Письмом Минфина РФ от 16.10.2007 № 03-11-04/2/259 разъясняется, что согласно изменениям, внесенным в НК РФ Федеральным законом от 17.05.2007 N 85-ФЗ « О внесении изменений в главы 21, 26.1, 26.2 и 26.3 части второй Налогового кодекса Российской Федерации» , организации и индивидуальные предприниматели, переведенные в соответствии с гл. 26.3 НК РФ на уплату ЕНВД для отдельных видов деятельности по одному или нескольким видам предпринимательской деятельности, вправе применять УСН в отношении иных осуществляемых ими видов предпринимательской деятельности. При этом ограничения по численности работников и стоимости основных средств и нематериальных активов, установленные гл. 26.2 НК РФ по отношению к таким организациям и индивидуальным предпринимателям, определяются исходя из всех осуществляемых ими видов деятельности. Предельная величина доходов, установленная п. 2 ст. 346.12 НК РФ, определяется по тем видам предпринимательской деятельности, налогообложение которых осуществляется в соответствии с общим режимом налогообложения. Данные изменения вступают в силу с 1 января 2008 г. (ст. 3 Федерального закона от 17.05.2007 № 85-ФЗ), то есть при переходе организаций на УСН с 1 января 2009 года.
Таким образом, если по действующим правилам при переходе на УСН вышеназванные организации должны в качестве ограничения учитывать доходы по всем видам деятельности независимо от применяемых в отношении них налоговых режимов, то по новым правилам предельная величина доходов, установленная п. 2 ст. 346.12 НК РФ, определяется по тем видам предпринимательской деятельности, налогообложение которых осуществляется в соответствии с общим режимом налогообложения и в отношении которых осуществляется переход на УСН.
Учитывая изложенное, организация, планирующая перейти на применение УСН с 1 января 2008 г., в целях ст. 346.12 НК РФ обязана учитывать доходы, полученные от осуществления всех видов предпринимательской деятельности, независимо от применяемых в отношении них налоговых режимов и подать соответствующее заявление в налоговый орган до 30 ноября 2007 года.